20 января 2009 года в Москве, Петербурге и Грозном прошли акции памяти убитых накануне Стаса Маркелова и Анастасии Бабуровой.
Московские антифашисты и анархисты (участники «Автономного действия», Конфедерации революционных анархо-синдикалистов, «Хранители Радуги», христианские анархисты и др.) и провели шествие в знак протеста против убийства Маркелова.
В 19:30 около 200 человек попытались начать демонстрацию в районе метро «Театральная», в сквере перед Большим театром, однако там их встретил ОМОН (как отмечает В. Тупикин, «по чьей-то неосторожности информация о первоначальном месте сбора просочилась в открытый интернет»). Возле станции метро «Театральная» были задержаны и избиты 15–20 человек. Затем, милиция задержала, избив при этом, группу из 8 человек, стоявшую на станции метро «Охотный ряд».
Рассредоточившись, оставшиеся участники шествия (около 250 человек) переместились к станции метро «Новокузнецкая» и прошли маршем по Пятницкой улице, затем по набережной Обводного канала, а затем по Большой Ордынке до станции метро «Третьяковская».
Демонстранты развернули баннеры «Для власти фашизм – хулиганство», «Нет беспределу!», «Фашисты убивают – власти покрывают!», зажгли фаеры и двинулись по проезжей части Пятницкой улицы. Во время шествия скандировали лозунги: «Фашизм убивает – власть покрывает!», «Свобода, равенство, анархо-коммунизм!», «Выйди на улицу – верни себе город!», «Антифа!», «Пока мы едины – мы непобедимы», «Помни Маркелова!», «Стас должен был жить!», «Настя должна была жить!» и др.
По дороге участники шествия переворачивали и бросали на дорогу урны и ограждения. Фаеры, урны, комки льда и снега полетели в окна офисов, одного из банков и ресторана «Макдоналдс».
Затем демонстрация спустилась прямо в метро «Третьяковская», продолжая скандировать лозунги. 
Произошли столкновения демонстрантов с милицией, во время которых разбились плафоны на эскалаторе. На «Третьяковской» было задержаны 5 участников шествия, причем, по информации очевидцев, милиционеры заставляли задержанных ложиться лицом в стеклянную крошку разбитых плафонов. Часть задержанных демонстранты отбили.
Всего вечером 20 января в связи с анарходемонстрацией было задержано около 50 человек. Через несколько часов они были отпущены после написания объяснений. Никаких обвинений задержанным предъявлено не было.
В Петербурге около 100 человек, в том числе антифашисты и анархисты, собрались у магазина «Буквоед» на Лиговском проспекте в 19:00. Вначале они были блокированы милицией, но затем им удалось договориться о проведении акции, и шествие в сторону Марсова поля началось. На самом Марсовом поле, у мемориала жертвам белого террора, прошел короткий митинг. Отдельные левые активисты заявляют о трех задержанных, однако эти данные не подтверждаются другими источниками.
Стало известно и о том, что на площади Дружбы народов в столице Чечни прошел митинг в связи с убийством Станислава Маркелова. В акции приняли участие более тысячи человек. Многие в Чечне шокированы убийством Маркелова. Представители политических партий, общественных и правозащитных организаций, молодежных движений и студенты провели в Грозном масштабную акцию протеста.
В руках у митингующих были транспаранты и плакаты с надписями: «Безнаказанность убийцы привела к новым убийствам!», «Буданову место в аду!», «Мы требуем правосудия!», «Уж если так, то всем свободу!», «Преступнику место в тюрьме!» и т.д. В акции участвовали и несколько десятков женщин, которые держали в руках фотографии своих убитых и пропавших без вести родных и близких.